MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dehalobacter sp. DCA chromosome

Total Repeats: 50535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018866	TA	3	6	15	20	50 %	50 %	0 %	0 %	410656643
2	NC_018866	CAA	2	6	123	128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410656643
3	NC_018866	CTGG	2	8	168	175	0 %	25 %	50 %	25 %	410656643
4	NC_018866	CTCG	2	8	189	196	0 %	25 %	25 %	50 %	410656643
5	NC_018866	GCA	2	6	385	390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410656643
6	NC_018866	CGG	2	6	441	446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410656643
7	NC_018866	ATGC	2	8	472	479	25 %	25 %	25 %	25 %	410656643
8	NC_018866	AATGA	2	10	550	559	60 %	20 %	20 %	0 %	410656643
9	NC_018866	TTA	2	6	622	627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656643
10	NC_018866	GGCA	2	8	648	655	25 %	0 %	50 %	25 %	410656643
11	NC_018866	AAG	2	6	656	661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656643
12	NC_018866	GAA	2	6	670	675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656643
13	NC_018866	CAA	2	6	708	713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410656643
14	NC_018866	ATT	2	6	721	726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656643
15	NC_018866	GA	3	6	744	749	50 %	0 %	50 %	0 %	410656643
16	NC_018866	TTCG	2	8	773	780	0 %	50 %	25 %	25 %	410656643
17	NC_018866	AAC	2	6	798	803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410656643
18	NC_018866	A	6	6	850	855	100 %	0 %	0 %	0 %	410656643
19	NC_018866	TGA	2	6	882	887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656643
20	NC_018866	ATT	3	9	889	897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656643
21	NC_018866	AACC	2	8	979	986	50 %	0 %	0 %	50 %	410656643
22	NC_018866	AGA	2	6	1005	1010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656643
23	NC_018866	A	6	6	1070	1075	100 %	0 %	0 %	0 %	410656643
24	NC_018866	AGA	2	6	1118	1123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656643
25	NC_018866	AAGAAC	2	12	1125	1136	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410656643
26	NC_018866	TCTT	2	8	1188	1195	0 %	75 %	0 %	25 %	410656643
27	NC_018866	GGA	2	6	1219	1224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410656643
28	NC_018866	TCAT	2	8	1241	1248	25 %	50 %	0 %	25 %	410656643
29	NC_018866	A	9	9	1272	1280	100 %	0 %	0 %	0 %	410656643
30	NC_018866	ATT	2	6	1312	1317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656643
31	NC_018866	GATTT	2	10	1617	1626	20 %	60 %	20 %	0 %	410656644
32	NC_018866	TCC	2	6	1656	1661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410656644
33	NC_018866	GAA	2	6	1779	1784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656644
34	NC_018866	GTT	2	6	1791	1796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656644
35	NC_018866	T	6	6	1810	1815	0 %	100 %	0 %	0 %	410656644
36	NC_018866	AAT	2	6	1869	1874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410656644
37	NC_018866	GAA	2	6	2031	2036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656644
38	NC_018866	TGC	2	6	2059	2064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656644
39	NC_018866	ATT	2	6	2166	2171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656644
40	NC_018866	GAT	2	6	2211	2216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656644
41	NC_018866	ATT	2	6	2250	2255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656644
42	NC_018866	AT	3	6	2355	2360	50 %	50 %	0 %	0 %	410656644
43	NC_018866	GATG	2	8	2372	2379	25 %	25 %	50 %	0 %	410656644
44	NC_018866	CT	3	6	2393	2398	0 %	50 %	0 %	50 %	410656644
45	NC_018866	ATCA	2	8	2466	2473	50 %	25 %	0 %	25 %	410656644
46	NC_018866	ATC	2	6	2559	2564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656644
47	NC_018866	GTT	2	6	2577	2582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656644
48	NC_018866	ATC	2	6	2615	2620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656644
49	NC_018866	TTA	2	6	2848	2853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656645
50	NC_018866	G	6	6	2899	2904	0 %	0 %	100 %	0 %	410656645
51	NC_018866	TC	3	6	2918	2923	0 %	50 %	0 %	50 %	410656645
52	NC_018866	TTA	2	6	2966	2971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656645
53	NC_018866	A	7	7	2981	2987	100 %	0 %	0 %	0 %	410656645
54	NC_018866	GAT	2	6	3066	3071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656645
55	NC_018866	A	6	6	3084	3089	100 %	0 %	0 %	0 %	410656645
56	NC_018866	AAG	2	6	3101	3106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656645
57	NC_018866	CTG	2	6	3120	3125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656645
58	NC_018866	A	6	6	3203	3208	100 %	0 %	0 %	0 %	410656645
59	NC_018866	T	6	6	3349	3354	0 %	100 %	0 %	0 %	410656645
60	NC_018866	A	6	6	3395	3400	100 %	0 %	0 %	0 %	410656645
61	NC_018866	A	7	7	3444	3450	100 %	0 %	0 %	0 %	410656645
62	NC_018866	GA	3	6	3465	3470	50 %	0 %	50 %	0 %	410656645
63	NC_018866	CGA	2	6	3497	3502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410656645
64	NC_018866	AAT	2	6	3503	3508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410656645
65	NC_018866	CAG	2	6	3555	3560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410656645
66	NC_018866	GCTG	2	8	3584	3591	0 %	25 %	50 %	25 %	410656645
67	NC_018866	ATC	2	6	3600	3605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656645
68	NC_018866	CTG	2	6	3636	3641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656645
69	NC_018866	GAT	2	6	3642	3647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656645
70	NC_018866	TTCT	2	8	3649	3656	0 %	75 %	0 %	25 %	410656645
71	NC_018866	ATC	2	6	3720	3725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656645
72	NC_018866	AGG	2	6	3798	3803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410656645
73	NC_018866	TAA	2	6	3830	3835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410656646
74	NC_018866	TAT	2	6	3836	3841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656646
75	NC_018866	CAG	2	6	3883	3888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410656646
76	NC_018866	TTG	2	6	3912	3917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656646
77	NC_018866	ATG	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656646
78	NC_018866	GAAAA	2	10	3964	3973	80 %	0 %	20 %	0 %	410656646
79	NC_018866	TGA	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656646
80	NC_018866	TTC	2	6	4016	4021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410656646
81	NC_018866	CAAAT	2	10	4290	4299	60 %	20 %	0 %	20 %	410656647
82	NC_018866	CCA	2	6	4389	4394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410656647
83	NC_018866	TTA	2	6	4482	4487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656647
84	NC_018866	TCA	2	6	4489	4494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656647
85	NC_018866	GA	3	6	4497	4502	50 %	0 %	50 %	0 %	410656647
86	NC_018866	ATGC	2	8	4544	4551	25 %	25 %	25 %	25 %	410656647
87	NC_018866	CGG	2	6	4600	4605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410656647
88	NC_018866	TAA	2	6	4612	4617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410656647
89	NC_018866	TGG	2	6	4636	4641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410656647
90	NC_018866	GTT	2	6	4664	4669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656647
91	NC_018866	A	6	6	4703	4708	100 %	0 %	0 %	0 %	410656647
92	NC_018866	GTAC	2	8	4773	4780	25 %	25 %	25 %	25 %	410656647
93	NC_018866	AAT	2	6	4955	4960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410656647
94	NC_018866	TGAT	2	8	4965	4972	25 %	50 %	25 %	0 %	410656647
95	NC_018866	TAAA	2	8	4986	4993	75 %	25 %	0 %	0 %	410656647
96	NC_018866	TCA	2	6	5008	5013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656647
97	NC_018866	ATA	2	6	5043	5048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410656647
98	NC_018866	TAA	2	6	5110	5115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410656647
99	NC_018866	GTT	2	6	5174	5179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656647
100	NC_018866	CG	3	6	5188	5193	0 %	0 %	50 %	50 %	410656647
101	NC_018866	ATT	2	6	5264	5269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656647
102	NC_018866	GACA	2	8	5301	5308	50 %	0 %	25 %	25 %	410656647
103	NC_018866	TGGT	2	8	5355	5362	0 %	50 %	50 %	0 %	410656647
104	NC_018866	T	7	7	5377	5383	0 %	100 %	0 %	0 %	410656647
105	NC_018866	GAA	2	6	5384	5389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656647
106	NC_018866	TTG	2	6	5412	5417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656647
107	NC_018866	GCC	2	6	5450	5455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410656647
108	NC_018866	CTT	2	6	5502	5507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410656647
109	NC_018866	GGC	2	6	5585	5590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410656647
110	NC_018866	GAA	2	6	5604	5609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656647
111	NC_018866	T	7	7	5834	5840	0 %	100 %	0 %	0 %	410656647
112	NC_018866	CAAA	2	8	5917	5924	75 %	0 %	0 %	25 %	410656647
113	NC_018866	TAAG	2	8	5952	5959	50 %	25 %	25 %	0 %	410656647
114	NC_018866	GAT	2	6	6089	6094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656647
115	NC_018866	A	7	7	6273	6279	100 %	0 %	0 %	0 %	410656648
116	NC_018866	ATT	2	6	6290	6295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656648
117	NC_018866	ATGA	2	8	6376	6383	50 %	25 %	25 %	0 %	410656648
118	NC_018866	ATG	2	6	6479	6484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656648
119	NC_018866	GCTG	2	8	6624	6631	0 %	25 %	50 %	25 %	410656648
120	NC_018866	ATG	2	6	6668	6673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656648
121	NC_018866	TTC	2	6	6732	6737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410656648
122	NC_018866	CCG	2	6	6769	6774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410656648
123	NC_018866	CGT	2	6	6801	6806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656648
124	NC_018866	TGA	2	6	6866	6871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656648
125	NC_018866	TTA	2	6	6875	6880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656648
126	NC_018866	GGAA	2	8	6921	6928	50 %	0 %	50 %	0 %	410656648
127	NC_018866	TCA	2	6	6929	6934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656648
128	NC_018866	ATCA	2	8	6957	6964	50 %	25 %	0 %	25 %	410656648
129	NC_018866	A	6	6	6989	6994	100 %	0 %	0 %	0 %	410656648
130	NC_018866	A	7	7	6998	7004	100 %	0 %	0 %	0 %	410656648
131	NC_018866	GTT	2	6	7021	7026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656648
132	NC_018866	GAAAA	2	10	7090	7099	80 %	0 %	20 %	0 %	410656648
133	NC_018866	GAA	2	6	7353	7358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656648
134	NC_018866	AGA	2	6	7362	7367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656648
135	NC_018866	TTG	2	6	7379	7384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656648
136	NC_018866	TTC	2	6	7437	7442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410656648
137	NC_018866	GAT	2	6	7447	7452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656648
138	NC_018866	GCCAAA	2	12	7459	7470	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410656648
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261	NC_018866	ATA	2	6	17968	17973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410656657
262	NC_018866	CTT	2	6	18008	18013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410656657
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